马来西亚理科大学开设专业涵盖了本科、硕士和博士学位课程，其中本科专业涵盖了计算机、会计、理科、应用科学、管理学、人文科学、教育学、社会科学等，硕士专业涵盖了公共关系硕士、经济管理硕士、药剂学硕士、工商管理硕士、多媒体教育学硕士、教育硕士等，博士专业涵盖了理学、应用文学、工程等领域，马来西亚理科大学专业广泛，课程丰富，给予学生更多专业选择机会。
马来西亚理科大学本科开设专业
1、计算机：软件工程 信息工程系统技术 多媒体处理 网络处理 智能系统分布式计算机系统与安全
2、会计：会计
3、纯理科：物理学 化学 数学 生物学（微生物、植物病理学、动物解剖学）
4、技术类：食品技术 环境技术 纸张及包装技术 生物资源
5、应用科学；地球物理 工程物理 医学物理 应用物理 分析化学 工业化学 操作研究 计算机模拟 数学模拟 数学与经济 应用统计学 生物技术 农业生物 海洋生物 环境生物 植物病理学 传染媒介与寄生物管理
6、房屋、建筑及规划：建筑管理 建筑技术 城市地区规划 建筑学 室内设计 测量
7、管理学：组织行为 市场学 操作管理 国际商务 金融
8、人文科学：英语语言学 马来语学 地理学 文学 历史 文科（翻译与口译）大众传媒 荧屏研究 诱劝性传媒 新闻学
9、教育学：学科教育
10、社会科学：人类学和社会学 经济学 社会工作 规划和管理发展 政治学
11、艺术类：音乐 设计和新媒体技术 产品设计 图像传媒 美术 演绎与引导
马来西亚理科大学硕士开设专业
1、MIXED MODE混合型：理硕士：原料工程、数学、统计、化学仪器、地理信息科学、旅游发展、综合医学、医学研究、环境工程、建筑工程、电子系统设计工程、输血科学、临床解剖学、医疗统计学、医科教育学。
文硕士：马来语、文学、传媒、翻译员和英语研究、翻译学
2、COURSEWORK MODE授课型：理硕士：计算机科学、信息科技、固体形态物理学、医学物理、企业管理、设计、建筑科技
住宅学、建筑环境、旅游发展、电子系统设计工程、运动学、数学教学。
传媒硕士：电影研究、新闻环境研究
工商管理硕士MBA，学费5.6万人民币
公共关系硕士
经济管理硕士
药剂学硕士（临床药剂学）
多媒体教育学硕士
教育硕士：课程研究、教育经营与管理、心理测试与教育评估、教育科学、英语教育/第二英语教学、教学技术、教育心理学、（对个人,社会以及心理等问题的）咨询/指导。
马来西亚理科大学博士开设专业
理学：数学、微生物学、海洋科学、应用昆虫学、应用寄生虫学、水生生物学、生物技术、植物学、化学、环境生物学、环境科学、分子生物学、物理学、植物病理学、统计学、动物学。
应用理学：可持续发展、建筑测量、生物化学分析、环境技术、食品技术、制药科学、社会与管理药学、药物化学、制药技术、生理学、药理学、数量测量、室内设计、项目管理、计算机科学、药学、药剂学、光电子学、临床药学、生物过程技术、生物资源、建筑学、建筑技术。
工程：航空航天工程、化学工程、土木工程、电气与电子工程、材料工程、机械工程、微电子系统工程、矿产资源工程、聚合物工程、河流与城市排水工程。
应用文学：教育、会计、传媒、戏剧、教育技术、金融、艺术、性别研究、管理、音乐、可持续发展、英语语言研究、文学、哲学。
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